建物名称	竣工年月日	総面積（㎡）	使用専攻、プログラム、センター	備考
生命棟	2001年3月	8,862	先端生命科学専攻、メディカル情報生命専攻、 生命データサイエンスセンター
基盤棟（Ⅰ期）	2002年3月	9,048	物質系専攻、先端エネルギー工学専攻、 複雑理工学専攻、核融合研究教育プログラム、 基盤科学領域創成研究教育プログラム、 海洋技術環境学専攻
基盤棟（Ⅱ期）	2003年10月	8,358	物質系専攻、先端エネルギー工学専攻、 複雑理工学専攻、核融合研究教育プログラム、 基盤科学領域創成研究教育プログラム、 海洋技術環境学専攻
基盤科学実験棟	2003年12月	5,630	物質系専攻、先端エネルギー工学専攻、 複雑理工学専攻、核融合研究教育プログラム
情報生命科学実験棟	2004年3月	1,056	メディカル情報生命専攻、 生命データサイエンスセンター
総合研究棟	2004年10月	2,200	メディカル情報生命専攻、 核融合研究教育プログラム	総合研究棟総面積15,793㎡のうち2,200㎡を使用
環境棟	2006年3月	20,800	自然環境学専攻、 海洋技術環境学専攻、 環境システム学専攻、人間環境学専攻、 社会文化環境学専攻、国際協力学専攻、 サステイナビリティ学グローバルリーダー養成大学院プログラム	2017（平成29）年度でPFI事業は終了
医科研2号館（白金台）	1967年度	766	メディカル情報生命専攻	借用スペース
総合研究棟	2004年度	413	メディカル情報生命専攻、物質系専攻、 先端エネルギー工学専攻	借用スペース
第2総合研究棟	2011年度	1,464	物質系専攻	借用スペース
産学官民連携棟（柏Ⅱ）	2019年度	793	メディカル情報生命専攻、 生命データサイエンスセンター、物質系専攻	借用スペース
計		59,390

※2022年4月時点