東京大学
理化学研究所

東京大学大学院理学系研究科の半場悠博士課程大学院生（研究当時。現在、理化学研究所生命医科学研究センターリサーチアソシエイト）・角田達彦教授（新領域創成科学研究科教授・理化学研究所生命医科学研究センターチームリーダー）らによる研究グループは、人の組織での長鎖遺伝子間非翻訳RNA（lincRNA）の発現と染色体のトポロジカルドメイン（TAD）のデータを用い、lincRNAの遺伝子座がタンパク質コード遺伝子（PCG）に比べてTADの内側の領域に著しく局在することや、TAD内のlincRNAはTAD外のlincRNAよりも発現の組織特異性が高いことを明らかにしました。そしてこれらに基づき、lincRNAを指標として転写状態を解釈するための解析フレームワークを提案しました。これを肥大型心筋症のデータに適用し、TADレベルのケラチンの異常発現、LINC00881の発現低下に伴うE2F1転写因子による筋細胞分化関連遺伝子の発現の抑制解除という、肥大型心筋症に特有の転写制御を発見しました。本成果により、将来的にゲノムの立体構造に依存したlincRNAの機能や制御が理解され、その医学的応用が可能になります。

本研究の概要図

詳細は、理学系研究科ウェブサイトをご覧ください。
https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2023/8396/