教員紹介

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富田　耕造

(とみた　こうぞう／教授／教授／生命科学研究系)

メディカル情報生命専攻／メディカルサイエンス群／RNA生物学

略歴

  • [学歴]
  • 1993年03月 東京大学 工学部 工業化学科卒
  • 1995年03月 東京大学大学院 工学系研究科 化学生命工学専攻 修士課程修了
  • 1998年03月 東京大学大学院 工学系研究科 化学生命工学専攻 博士課程修了（渡辺公綱教授）
  • [職歴]
  • 1998年03月 博士（工学）の学位取得 （東京大学）1998年04月 東京大学大学院 農学系研究科 共同博士研究員 （正木春彦教授）
  • 1998年10月 IBMP du CNRS　（仏、Strasbourg）博士研究員（Laurence Marechal-Drouard博士）
  • 1999年10月 Yale 大学 医学部 （米、New Haven）博士研究員 （Alan M Weiner教授）
  • 2000年08月 Washington大学 医学部（米、Seattle）博士研究員 （Alan M Weiner教授）
  • 2002年04月 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 研究員、助手
  • 2004年04月 独）産業技術総合研究所 生物機能工学研究部門 研究員
  • 2005年04月 同部門 機能性核酸研究グループ長 （～2010年3月）
  • 2006年04月 東京大学大学院 新領域創成科学研究科メディカルゲノム専攻　客員連携准教授　（〜2011年3月
  • 2007年10月 独）科学技術振興機構　戦略的創造研究推進事業 「RNAと生体機能」(研究総括：野本明男教授）さきがけ研究員 兼任 （～2011年3月）
  • 2010年04月 独）産業技術総合研究所 バイオメディカル研究部門 RNAプロセシング研究グループ長 （～2015年3月
  • 2010年04月 東京大学大学院 新領域創成科学研究科メディカルゲノム専攻　客員連携教授 (～2015年3月)
  • 2015年04月東京大学大学院 新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻　客員連携教授～2016年3月）
  • 2015年04月 国立研究開発法人　産業技術総合研究所　バイオメディカル研究部門　RNAプロセシング特別研究チーム長（～2016年3月）
  • 2016年04月　東京大学大学院新領域創成科学研究科　メディカル情報生命専攻　RNA生物学分野　教授
  • [受賞]
  • 2010年4月 文部科学大臣表彰 科学技術分野（研究部門）（本人）
    「酵素反応の動的分子機構の構造的研究」
  • 2008年12月 日本分子生物学会 第6回 日本分子生物学会三菱化学奨励賞 （本人）
    「鋳型非依存的RNA合成酵素の進化・分子機構に関する研究」
    (Mechanism and evolution of template-independent RNA polymerases)
  • 2007年10月 茨城県科学振興財団 第17回つくば奨励賞 若手研究者部門 (本人)
    「鋳型を用いないRNA合成酵素の分子構造基盤研究」

教育活動

大学院：基礎講義II

研究活動

RNAのプロセシングの分子基盤研究

文献

  1. *Ohira, T., Minowa, K., Sugiyama, K., Yamashita, S., Sakaguchi, Y., Miyauchi, K., Noguchi, R., Kaneko, A., Orita, I., Fukui, T., *Tomita, K., *Suzuki T.
    Reversible RNA phosphorylation stabilizes tRNA for cellular thermotolerance.
    Nature, doi.org/10.1038/s41586-022-04677-2, 2022
  2. Yashiro Y, Zhang C, Sakaguchi Y, Suzuki T, *Tomita K.
    Molecular basis of glycyl-tRNAGly acetylation by TacT from Salmonella Trphimurium.
    Cell Reports, doi: 10.1016/j.celrep.2021.110130, 2021
  3. Yashiro Y, Sakaguchi Y, Suzuki T, *Tomita K.
    Mechanism of aminoacyl-tRNA acetylation by an aminoacyl-tRNA acetyltransferase AtaT from enterohemorrhagic E. coli.
    Nature Communications, doi: 10.1038/s41467-020-19281-z, 2020
  4. Yamashita S, Nagaike T, *Tomita K.
    Crystal structures of the Lin28-interacting module of human terminal uridylyltransferase that regulates let-7 expression.
    Nature Communications, doi: 10.1038/s41467-019-09966-5, 2019
  5. Taniguchi T, Miyauchi K, Sakaguchi Y, Yamashita S, Soma A, Tomita K, *Suzuki T.
    Acetate-dependent tRNA acetylation required for decoding fidelity in protein synthesis.
    Nature Chemical Biology, doi: 10.1038/s41589-018-0119-z, 2018
  6. Yamashita S, Takagi Y, Nagaike T, *Tomita K.
    Crystal structures of U6 snRNA-specific terminal uridylyltransferase.
    Nature Communications, doi:10.1038/ncomms15788, 2017
  7. Takeshita D, *Tomita K
    Molecular basis for RNA polymerization by Qβ replicase
    Nature Structural & Molecular Biology Vol.19, No2, pp229-237, 2012
  8. Takeshita D, *Tomita K
    Assembly of Qβ viral RNA polymerase with host translational elongation factors EF-Tu and -Ts.
    Proc Natl Acad Sci U S A. Vol. 107, No 36, pp15733-15738, 2010
  9. Toh Y, Takeshita D, Numata T, Fukai S, Nureki O, *Tomita K
    Mechanism for the definition of elongation and termination by the class II CCA-adding enzyme.
    EMBO J. vol. 28, No 21, pp3353-3365, 2009
  10. Toh Y, Numata T, Watanabe K, Takeshita D, Nureki O, *Tomita K
    Molecular basis for maintenance of fidelity during the CCA-adding reaction by a CCA-adding enzyme.
    EMBO J. Vol. 27, No 14, pp1944-1952, 2008
  11. Watanabe K, Toh Y, Suto K, Shimizu Y, Oka N, Wada T, *Tomita K
    Protein-based peptide-bond formation by aminoacyl-tRNA protein transferase.
    Nature. Vol.449, No 7164, pp867-871, 2007
  12. Suto K, Shimizu Y, Watanabe K, Ueda T, Fukai S, Nureki O, *Tomita K
    Crystal structures of leucyl/phenylalanyl-tRNA-protein transferase and its complex with an aminoacyl-tRNA analog.
    EMBO J. Vol.25, No 24, pp5942-50, 2006
  13. *Tomita K, Ishitani R, Fukai S, Nureki O.
    Complete crystallographic analysis of the dynamics of CCA sequence addition.
    Nature. Vol. 443, No 7114, 956-960, 2006
  14. Tomita K, Fukai S, Ishitani R, Ueda T, Takeuchi N, Vassylyev DG, Nureki O.
    Structural basis for template-independent RNA polymerization.
    Nature. Vol. 430, No 7000, 700-704, 2004
  15. Okabe M, Tomita K, Ishitani R, Ishii R, Takeuchi N, Arisaka F, Nureki O, Yokoyama S.
    Divergent evolutions of trinucleotide polymerization revealed by an archaeal CCA-adding enzyme structure.
    EMBO J. Vol. 22, No 21, pp5918-5927, 2003
  16. Li F, Xiong Y, Wang J, Cho HD, Tomita K, Weiner AM, Steitz TA.
    Crystal structures of the Bacillus stearothermophilus CCA-adding enzyme and its complexes with ATP or CTP.
    Cell. Vol. 111, No 6, pp815-824, 2002
  17. Tomita K, Weiner AM.
    Collaboration between CC- and A-adding enzymes to build and repair the3′-terminal CCA of tRNA in Aquifex aeolicus.
    Science Vol. 294, No 5545, pp1334-1336, 2001
  18. Tomita K, Ogawa T, Uozumi T, Watanabe K, Masaki H.
    A cytotoxic ribonuclease which specifically cleaves four isoaccepting arginine tRNAs at their anticodon loops.
    Proc Natl Acad Sci U S A. Vol. 97, No 15, pp8278-8283, 2000
  19. Ogawa T, Tomita K, Ueda T, Watanabe K, Uozumi T, Masaki H.
    A cytotoxic ribonuclease targeting specific transfer RNA anticodons.
    Science. Vol. 283, No 5410, pp2097-2100, 1999

その他

日本分子生物学会、日本RNA学会

教員からのメッセージ

生命現象の基盤を明らかにすることを目指しています。

ホームページのURL

https://webpark1918.sakura.ne.jp/

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